Secondo me se facevi lo gnorri te la cavavi.
Mai sentito della guardia costiera che rimorchia una imbarcazione se non in caso di assoluta minaccia per l'incolumità dell'equipaggio o degli altri.
Se veramente erano inca**ati, al limite dopo un po si sarebbero messi ancora per qualche tempo in agguato per vedere se tornava qualcuno a bordo.
Non hai specificato dove ti trovavi, e se in quel punto è in vigore una ordinanza che vieta espressamente di lasciare incustodita una imbarcazione alla fonda. Contrariamente a quel che molti credono non esiste nessuna legge o normativa che lo vieti, ma solo alcune specifiche ordinanze.
Nel caso, se potevi lasciare la barca incustodita non avrebbero potuto verbalizzare e quindi secondo me se non vi erano condizioni di reale rischio o pericolo difficilmente si sarebbero preso la briga di sequestrare il mezzo, operazione che tra l'altro richiede l'autorizzazione della magistratura a quanto ricordo.
Certo che il buon senso spinge un onesto cittadino a rispondere ai lampeggianti come hai fatto tu.